截至 2019 年 6 月 26 日（美國時間）的已知問題
1. 開啟「魔法部 ID」與照相模式時可能發生錯誤，導致必須重開遊戲。
2. 進行中的「每日指定任務」和「成就」可能不會正確完成。重新開啟遊戲再次檢查進度可以解決此問題。
3. 如果一個登錄冊頁面可以增加威望，玩家可能不會收到相關通知。此時你會看到登錄冊頁面上有紅點，直到你升級完威望為止。
4. 在「下載所有資源」時可能無法完整完成下載，重新開啟遊戲可以解決這個問題。
5. 在「下載所有資源」時可能會出現空間不足提示，儘管你的裝置擁有足夠的可用空間。
6. 「魔法部 ID」目前無法儲存你選擇的「稱號」和「魔法成就」。
7. 當你歸還魔現時，即使你已經放置圖像，仍然有可能看到畫面中顯示「+1」的提示。
8. 如果你在 iOS 系統上同時使用 Facebook 與 Google 帳號登入遊戲，將會無法進行應用程式內購。
9. 正氣師職業中的能力「與假人共舞」並未正確發揮效果，提升第一次攻擊的爆擊率。
【哈利波特：巫師聯盟】正式上線至今一週，並未造成如三年前【精靈寶可夢 GO】一般的全球轟動，英、美兩國上市首日下載量僅有後者上市首日紀錄的 5%，但仍然迅速登上全球二十多個國家的 App 應用商店下載榜首。不過，官方已經規劃好未來一系列更新，除了「大災難」這個橫跨多年的故事進展，也會有更多新功能推出，都將持續增加這款遊戲的吸引力。
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