在北美上映第二週就被【音速小子 2】奪回週末票房冠軍，【怪獸與鄧不利多的秘密】目前在北美累積票房僅 7955 萬美元，剛好落於【怪獸與葛林戴華德的罪行】在北美總票房的一半；本片在國際票房的表現明顯好於美國本土，於巴西、法國、德國、墨西哥及日本等市場皆持續創造疫情後票房佳績，使目前海外票房已累積約 2 億 5000 美元，全球總票房亦終於突破三億美元關卡，來到 3 億 2900 萬美元。
台灣票房表現受到疫情影響，電影院的上座率明顯下滑，不過【怪獸與鄧不利多的秘密】仍然在全台票房突破 1 億新台幣大關，成為今年第四部在台灣賣超過一億新台幣的電影，緊追在此波疫情爆發前同樣由華納發行的【蝙蝠俠】之後。
儘管再下一座票房里程碑，本片仍然距離勉強打平成本的 4 億 5000 萬全球票房尚遠；而隨著下個週末就有【奇異博士 2：瘋狂多重宇宙】這部強檔將在全球上映，【怪獸與鄧不利多的秘密】能繼續累積的票房數字顯然已所剩不多。據外國媒體報導，近期母公司才剛與探索頻道集團完成合併的華納兄弟影業，正在觀察本片的電影票房、觀眾反應，同時還會考量本片五月底在 HBO Max 等串流平台上架後的觀賞數據，將會於幾週到幾個月內決定是否放行【怪獸 4】等續集電影展開製作。
雖然票房數字看起來並不樂觀，哈迷們目前暫時不用太擔心《怪獸》系列被取消──華納兄弟美國發行業務總監傑夫‧金坦 (Jeff Goldstein) 近期才向 The Wrap 表示：「《怪獸》系列一直都是打造《魔法世界》的更宏觀計畫中的一塊拼圖，儘管【怪獸與鄧不利多的秘密】票房數字看起來比前幾部低，我們仍然認為這個系列對讓《魔法世界》在人們心中有新鮮感這件事上有功，而我們相當滿意從主題樂園、商店以及其他產品及體驗中獲得的收入。」
對華納而言，《怪獸》系列電影持續推出的重點或許不在單靠票房收入賺錢，而是帶動《魔法世界》話題性進而促進週邊商品、景點及活動的收入；儘管目前已有其他《魔法世界》影視作品──譬如傳聞可能會在今年有消息的《魔法世界》影集──正在開發中，這個龐大的系列仍然需要一個在大銀幕上持續推進的指標。而在華納想辦法說服作者 J.K. 羅琳以及丹尼爾‧雷德克里夫、魯柏‧格林特、艾瑪‧華森等主角重回劇組拍攝【哈利波特：被詛咒的孩子】前，至少還有幾年的大銀幕仍然有《怪獸》生存的空間，只待哈迷們能早點盼望到好消息。
