儘管在全球票房，【哈利波特：混血王子的背叛】票房已經超越今年的另一部大片【變形金剛：復仇之戰】，不過哈利波特在台灣的受歡迎程度再度受到考驗。這部獲得哈利波特系列中最高評價的電影，同時也是歷史上電影觀眾評價排行前三十名的電影（按：BOM 排行，最大的電影網站之一），在台灣似乎並不受到青睞。
除了由台灣觀眾所評出的評價分數較低（以滿分 100 分為例：國外觀眾多數給予本片 70 ~ 90 分的評價，平均為 85 分；台灣多數觀眾則給予本片 50 ~ 70 分的評價，平均分數為 65 分），反映在票房表現上更是明顯差距。哈利波特第六集在台北票房目前累積至新台幣９５８２萬元，仍然未破億，確定成為哈利波特系列在台灣票房最低的電影，離上一集的１億３０００萬台北票房有相當大的差距；不過，本次台北地區以外的票房倒是沒有如此遜色，和上一集幾乎持平，但台灣整體票房仍然落後。
若是與今年在台灣的票房冠軍，【變形金剛：復仇之戰】相比，該片在台北票房已有２億３３０４萬新台幣的破記錄亮眼成績，哈利波特的票房相比之下可說是「完全無法比」；這種形勢差距反應到了近期的一個現象上：台北美麗華大直影城 IMAX 影廳由於先前的映期問題而無法準時上映【變形金剛：復仇之戰 IMAX 版】，現在該片已經上映近兩個月，該影城才得以將影片與【哈利波特：混血王子的背叛 IMAX 3D 版】輪流播映，竟然出現了哈利波特電影票幾乎沒人訂票，變形金剛場次卻場場爆滿的情況，兩者形成的氣候截然不同。
或許下一集哈利波特得改變風格，才有機會再吸引台灣的觀眾們對這部電影的興趣──而導演大衛‧葉慈確認了接下來兩部電影的風格朝向史詩、冒險動作電影的方向走，如果台灣觀眾在當年【魔戒】系列創下了當時的票房紀錄，或許哈利波特系列仍然有機會重振熱潮。
